ทำเนียบนามอธิการบดี สมเด็จพระพุทธโฆษาจารย์ (ฟื้น ชุตินฺธโร ป.ธ.๙) พ.ศ. ๒๔๙๐ – ๒๔๙๑ สมเด็จพระธีรญาณมุนี (ธีร์ ปุณฺณโก ป.ธ.๙) พ.ศ. ๒๔๙๑ – ๒๔๙๖ พระธรรมวรนายก (สมบูรณ์ จนฺทโก ป.ธ.๖) พ.ศ. ๒๔๙๖ – ๒๕๒๙ พระราชรัตนโมลี (นคร เขมปาลี ป.ธ.๖, Ph.D.) พ.ศ. ๒๕๒๙ – ๒๕๔๐ พระพรหมบัณฑิต, ศ.ดร. (ประยูร ธมฺมจิตฺโต ป.ธ.๙, พธ.บ., M.A., Ph.D. ) พ.ศ. ๒๕๔๐ – ๒๕๖๑ พระธรรมวัชรบัณฑิต, ศ.ดร. (สมจินต์ สมฺมาปญฺโญ ป.ธ.๙, ศษ.บ., พธ.ม., Ph.D.) พ.ศ. ๒๕๖๑ – ปัจจุบัน
